Diplomado en Ciencias Ómicas

Diplomado

En Cali

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Descripción

  • Tipología

    Diplomado

  • Lugar

    Cali

  • Horas lectivas

    100h

En este diplomado el estudiante obtendrá una formación especializada en el sistema operativo Linux con el fin de poder manipular e interpretar datos biológicos, a partir del uso de herramientas y flujos de trabajo para el análisis de datos ómicos de secuenciación de siguiente generación (NGS). Además, al finalizar el diplomado podrá realizar análisis de genómica, metagenómica, transcriptómica y GWAS.

Sedes y fechas disponibles

Ubicación

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Cali (Valle del Cauca)
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Ciudad Universitaria Meléndez: Carrera 100 No. 13-00.

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A tener en cuenta

Utilizar el sistema operativo Linux para realizar análisis en las ciencias ómicas.
Evaluar la calidad de los datos omicos.
Realizar ensamblado de secuencias obtenidas por NGS
Realizar análisis de Metagenómica
Realizar análisis de genómica funcional o transcriptómica
Realizar estudios de asociación genómica-GWAS

Profesionales, investigadores o estudiantes de posgrado del área de las ciencias de la vida y de la salud, preferiblemente que se encuentren realizando o planeen realizar investigaciones que requieran del análisis bioinformática de datos ómicos derivados de tecnologías de secuenciación de alto rendimiento o siguiente generación (NGS).

Copia de la cédula
Certificado de afiliación a la EPS
Copia del diploma o acta de grado de pregrado

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Logros de este Centro

2020

Todos los cursos están actualizados

La valoración media es superior a 3,7

Más de 50 opiniones en los últimos 12 meses

Este centro lleva 14 años en Emagister.

Materias

  • Análisis de datos
  • Programación en shell
  • Bases de datos biológicas
  • Algoritmos
  • Tecnologías de secuenciación
  • Anotación de genomas
  • Análisis comparativo de genomas
  • Ensamblaje de metagenomas
  • Control de calidad
  • Linux

Programa académico

Primer Módulo

Temas:

Introducción al sistema operativo Linux, conocimientos básicos para la administración y utilización (16 horas / semana 1 y 2)

Introducción a Linux

Estructura del sistema de archivos en Linux

Proceso de arranque, inicio y cierre del sistema

Comandos básicos de Linux: Shell

Redirecciones y tuberías

Editores

Ejecución de programas

Programación en Shell

Introducción a las ciencias ómicas (16 horas / semana 3 y 4)

Dogma central de la Biología Molecular y su relación con las ciencias ómicas

Bases de datos biológicas

Introducción a NGS

Fundamentos de Bioinformática en la generación Omas y Ómicas

Diseño de un experimento en NGS

Construcción de librerías (shot-gun, paired-end, mate-pair, multiplexing)

Tecnologías de secuenciación

Formatos de secuencia y códigos de calidad

Control de Calidad de datos NGS y análisis de datos genómicos (16 horas / semana 5 y 6)

Control de calidad y filtrado de lecturas

Algoritmos y estrategias de ensamblado de secuencias

Nuevos algoritmos para ensamblajes híbridos

Secuenciación del genoma completo y resecuenciación

Secuenciación dirigida

Ensamblaje y post ensamblaje de pequeños genomas

Anotación de genomas

Análisis comparativo de genomas

Visualización de genomas

Segundo Módulo

Metagenómica (16 horas / semana 8 y 9)

Microbiomas y perfiles genéticos de comunidades

Conceptos básicos de diversidad de comunidades microbianas: riqueza, estructura, diversidad alfa, beta y gamma

Ensamblaje de metagenomas

Algoritmos de ensamblaje de metagenomas

Análisis funcional de metagenomas

Genómica funcional: transcriptómica (16 horas / semana 10 y 11)

Introducción a RNA-seq

Consideraciones Experimentales y Prácticas

Control de Calidad

Ensamblaje de transcriptomas y Visualización de Datos

Expresión Diferencial

Anotación Funcional

Estudios de asociación genómica-GWAS (16 horas / semana 12 y 13)

Introducción y manejo de datos (genomas, Chip/arrays)

Análisis de calidad de los datos y manejo del programa Plink

Análisis estadístico y la asociación estadística

Análisis de mezclas poblacionales

Elección de genes candidatos

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