Diplomado en Ciencias Ómicas
Diplomado
En Cali
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Descripción
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Tipología
Diplomado
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Lugar
Cali
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Horas lectivas
100h
En este diplomado el estudiante obtendrá una formación especializada en el sistema operativo Linux con el fin de poder manipular e interpretar datos biológicos, a partir del uso de herramientas y flujos de trabajo para el análisis de datos ómicos de secuenciación de siguiente generación (NGS). Además, al finalizar el diplomado podrá realizar análisis de genómica, metagenómica, transcriptómica y GWAS.
Sedes y fechas disponibles
Ubicación
Inicio
Inicio
A tener en cuenta
Utilizar el sistema operativo Linux para realizar análisis en las ciencias ómicas.
Evaluar la calidad de los datos omicos.
Realizar ensamblado de secuencias obtenidas por NGS
Realizar análisis de Metagenómica
Realizar análisis de genómica funcional o transcriptómica
Realizar estudios de asociación genómica-GWAS
Profesionales, investigadores o estudiantes de posgrado del área de las ciencias de la vida y de la salud, preferiblemente que se encuentren realizando o planeen realizar investigaciones que requieran del análisis bioinformática de datos ómicos derivados de tecnologías de secuenciación de alto rendimiento o siguiente generación (NGS).
Copia de la cédula
Certificado de afiliación a la EPS
Copia del diploma o acta de grado de pregrado
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Opiniones
Logros de este Centro
Todos los cursos están actualizados
La valoración media es superior a 3,7
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Materias
- Análisis de datos
- Programación en shell
- Bases de datos biológicas
- Algoritmos
- Tecnologías de secuenciación
- Anotación de genomas
- Análisis comparativo de genomas
- Ensamblaje de metagenomas
- Control de calidad
- Linux
Programa académico
Primer Módulo
Temas:
Introducción al sistema operativo Linux, conocimientos básicos para la administración y utilización (16 horas / semana 1 y 2)
Introducción a Linux
Estructura del sistema de archivos en Linux
Proceso de arranque, inicio y cierre del sistema
Comandos básicos de Linux: Shell
Redirecciones y tuberías
Editores
Ejecución de programas
Programación en Shell
Introducción a las ciencias ómicas (16 horas / semana 3 y 4)
Dogma central de la Biología Molecular y su relación con las ciencias ómicas
Bases de datos biológicas
Introducción a NGS
Fundamentos de Bioinformática en la generación Omas y Ómicas
Diseño de un experimento en NGS
Construcción de librerías (shot-gun, paired-end, mate-pair, multiplexing)
Tecnologías de secuenciación
Formatos de secuencia y códigos de calidad
Control de Calidad de datos NGS y análisis de datos genómicos (16 horas / semana 5 y 6)
Control de calidad y filtrado de lecturas
Algoritmos y estrategias de ensamblado de secuencias
Nuevos algoritmos para ensamblajes híbridos
Secuenciación del genoma completo y resecuenciación
Secuenciación dirigida
Ensamblaje y post ensamblaje de pequeños genomas
Anotación de genomas
Análisis comparativo de genomas
Visualización de genomas
Segundo Módulo
Metagenómica (16 horas / semana 8 y 9)
Microbiomas y perfiles genéticos de comunidades
Conceptos básicos de diversidad de comunidades microbianas: riqueza, estructura, diversidad alfa, beta y gamma
Ensamblaje de metagenomas
Algoritmos de ensamblaje de metagenomas
Análisis funcional de metagenomas
Genómica funcional: transcriptómica (16 horas / semana 10 y 11)
Introducción a RNA-seq
Consideraciones Experimentales y Prácticas
Control de Calidad
Ensamblaje de transcriptomas y Visualización de Datos
Expresión Diferencial
Anotación Funcional
Estudios de asociación genómica-GWAS (16 horas / semana 12 y 13)
Introducción y manejo de datos (genomas, Chip/arrays)
Análisis de calidad de los datos y manejo del programa Plink
Análisis estadístico y la asociación estadística
Análisis de mezclas poblacionales
Elección de genes candidatos
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Diplomado en Ciencias Ómicas