Bioinformática y metagenómica aplicada al estudio de microbiomas

Universidad del Valle

Curso

En Cali

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Descripción

  • Tipología

    Curso

  • Lugar

    Cali

El curso “Bioinformática y metagenómica aplicada al estudio de microbiomas” esta orientado hacia el manejo de información relacionada con datos para el estudio de diversidad microbiana y metagenómica. En este curso se ilustrará a los participantes en el manejo de bases de datos bioinformáticas públicas con el fin de interpretar datos metagenómicos, incluyendo enfoques basados en marcadores génicos, así como en la técnica “whole genome shotgun sequencing”. El análisis de datos basados en marcadores génicos se llevará a cabo por medio del software R, el cual se utilizará para conducir análisis multivariados aplicando conceptos de ecología microbiana para explorar y comparar sets de datos. Se harán talleres demostrativos de aplicación de la ecología microbiana comparativa y casos de estudio la interacción insecto-bacteria y patógeno-vector. También se realizarán discusiones acerca de los desafíos y perspectivas de la metagenómica.

Sedes y fechas disponibles

Ubicación

Inicio

Cali (Valle del Cauca)
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Ciudad Universitaria Meléndez: Carrera 100 No. 13-00.

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A tener en cuenta

Introducir a los participantes en el manejo de conceptos y herramientas bioinformáticas para el análisis metagenómico.

Objetivos Específicos:
Identificar los conceptos básicos y herramientas bioinformáticas disponibles para el análisis metagenómico.
Adquirir habilidades para la formulación de proyectos de investigación en el área de metagenómica.

Investigadores y estudiantes que deseen capacitarse manejo de datos para estudios de diversidad microbiana y metagenómica.

Una vez que solicites información por medio del catálogo de Emagister.com.co el centro se pondrá en contacto contigo para informarte del proceso de matriculación.

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Logros de este Centro

2020

Todos los cursos están actualizados

La valoración media es superior a 3,7

Más de 50 opiniones en los últimos 12 meses

Este centro lleva 14 años en Emagister.

Materias

  • Análisis de datos
  • Datos en bioinformática
  • Diseño de experimentos
  • Técnicas de secuenciamiento
  • Datos en metagenómica
  • Sometimiento de secuencias
  • Estadística Multivariada
  • Microbiana comparativa
  • Bioinformática
  • Ecología

Programa académico

Día 1

Presentación del curso y de los asistentes (30 minutos)

Introducción a la bioinformática (teoría, 1.5 horas)

Introducción a las ciencias “omicas” y meta (omicas) (teoría, 2 horas)

Bases de datos en bioinformática (practica, 4 horas)

Día 2

Continuación bases de datos en bioinformática (practica 3 horas)

Introducción a metagenómica y diseño de experimentos (teoría, 1 hora)

Técnicas de secuenciamiento para metagenómica (teoría, 1 hora)

Introducción al análisis de datos en metagenómica (teoría, 1 hora)

Sometimiento de secuencias y metadatos a ENA (teoría, 1 hora)

Metagenómica y sus aplicaciones (teoría, 1 hora)

Día 3

Bases de datos en metagenómica (practica, 5 horas)

Introducción a estadística multivariada (teoría, 1 hora)

Ecología microbiana comparativa (teoría, 1 hora)

Ecología microbiana comparativa (práctica, 1 hora)

Día 4

Ecología microbiana comparativa (práctica, 6 horas)

Herramientas online para la visualización de matrices (práctica, 2 horas)

Día 5

Metagenómica aplicada al estudio de la interacción parásito-vector (teoría, 1 hora)

“omicas” aplicadas al estudio de la interacción patógeno-hospedero (teoría, 1 hora)

Trabajo con estudiantes (práctica, 6 horas)

Discusión acerca de los desafíos y fallas en metagenómica

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